Институт осуществляет международную деятельность в соответствии с ежегодным планом мероприятий международного сотрудничества МЧС России, а также исполняет возложенные на институт обязательства по участию в рабочих группах, среди которых:

• группа координаторов по реализации Сендайской рамочной программы по снижению риска бедствий на 2015-2030 годы;
• Европейская группа по науке и технологиям для реализации Сендайской рамочной программы по снижению риска бедствий на 2015-2030 годы (E-STAG);
• Рабочая группа экспертов Экономико-социальной комиссии ООН по Азии и Тихому океану (ЭСКАТО);
• Рабочая группа открытого состава Базельской конвенции о контроле за трансграничной перевозкой опасных отходов и их удалением;
• Экспертная группа МАГАТЭ;
• Целевая группа МСЭ/ВМО/ЮНЕП по искусственному интеллекту (ИИ) для борьбы со стихийными бедствиями;
• Межправительственная группа экспертов (МГЭ) по статистике, связанной со стихийными бедствиями.

В 2009 году решением Совета глав правительств Содружества Независимых Государств ВНИИ ГОЧС МЧС России был придан статус базовой организации государств-участников СНГ в области науки и высоких технологий с целью координации деятельности научных организаций в сфере предупреждения и ликвидации чрезвычайных ситуаций на пространстве СНГ.

В 2016 году по решению МОГО институту предоставлен статус аффилированного члена Международной организации гражданской обороны.

Приказом Росстандарта от 22.01.2015 № 55 обязанности постоянно действующего национального органа в техническом комитете Международной организации по стандартизации ИСО/TK 292 «Безопасность и устойчивость» возложены на ТК 071 «Гражданская оборона, предупреждение и ликвидация чрезвычайных ситуаций», функционирующий на базе института (так называемый зеркальный технический комитет).

Решением руководства МЧС России от 18.11.2015 г. № 2-4-46-2444-10 на институт возложено выполнение обязанностей национального координатора по реализации Сендайской рамочной программы по снижению риска бедствий на 2015-2030 годы.

В 1996 году МЧС России в рамках Частичного открытого соглашения по прогнозированию, предотвращению и оказанию помощи в случае природных и техногенных катастроф Совета Европы (ЧОС СЕ) (EUR-OPA Major Hazards Agreement) создал российский центр – Европейский центр новых технологий управления рисками стихийных бедствий и техногенных катастроф (ЕЦНТУР), с 2006 г. до 28.06.22 он функционировал в составе ФГБУ ВНИИ ГОЧС. Решением Правительства Российской Федерации Россия прекратила участие в частичных и расширенных частичных соглашениях Совета Европы (Постановление Правительства Российской Федерации от 28.06.2022 № 1155).